Kali ini PA & PP Al-Mizan Muhammadiyah Lamongan juga meiliki fasilitas berbagai perpustakaan yang terpusatkan di Al-Mizan Gedung 1 lebih tepatnya di lantai 3. Demi menunjang aktivitas pendidikan dan pengajaran, keberadaan perpustakaan yang menyediakan referensi atau sumber informasi di sebuah lembaga pendidikan memiliki peranan yang penting. adapun fasilitas yang ada didalam perpustakaan bersama PA & PP Al-Mizan Muhammadiyah Lamongan adalah kursi, meja, komputer operator, aplikasi digital perpustakaan, rak buku dan tak lupa kipas angin ruangan untuk menjaga kenyamanan dan berupaya untuk mempermudah administrasi serta aktivitas pengunjung di perpustakaan.
Selain memiliki fungsi akademisi dan informasi, perpustakaan yang bersama PA & PP Al-Mizan Muhammadiyah Lamongan ini juga memiliki fungsi filosofis. Hal ini dikaitkan dengan wahyu yang pertama kali diturunkan kepada Nabi Muhammad SAW yang berbunyi IQRO’, sebuah perintah untuk terus membaca dan membaca. Kehidupan manusia laksana perjalanan matahari terbit dari timur dan tenggelam ke barat, juga turut menginspirasi pendirian perpustakaan ini.